生物接觸氧化法凈化廢水的基本原理與一般生物膜法相同，就是以生物膜吸附廢水中的有機物，在有氧的條件下，有機物由微生物氧化分解，廢水得到凈化。

生物接觸氧化池內的生物膜由菌膠團、絲狀菌、真菌、原生動物和后生動物組成。在活性污泥法中，絲狀菌常常是影響正常生物凈化作用的因素；而在生物接觸氧化池中，絲狀菌在填料空隙間呈立體結構，大大增加了生物相與廢水的接觸表面，同時因為絲狀菌對多數有機物具有較強的氧化能力，對水質負荷變化有較大的適應性，所以是提高凈化能力的有力因素。

生物接觸氧化法的 BOD負荷與廢水的基質濃度有關，對低BOD濃度（50～300毫克／升）廢水每日每立方米的填料采用2～5千克(BOD)，廢水停留時間為0.5～1.5小時，氧化池內耗氧量約1～3毫克／升。由于氧化池內生物量較大，處理負荷高，可控制溶解氧量較高，一般要求氧化池出水中剩余溶解氧為2～3毫克／升。

生物接觸氧化法的優點是：凈化效率高；處理所需時間短；對進水有機負荷的變動適應性較強；不必進行污泥回流，同時沒有污泥膨脹問題；運行管理方便。